Ingénieur-e biologiste en analyse de données

À propos de nous Nantes Université est un établissement public d'enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d'université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l'école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l'École Nationale Supérieure d'Architecture de Nantes. Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l'excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance. Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d'études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon. Mission Missions

• Mettre en œuvre les méthodes déjà en place pour l'analyse de données de transcriptomique et d'épigénomique dans le cadre de plusieurs projets de recherche de l'équipe.
• Assurer une veille méthodologique et actualiser les méthodes existantes afin de rester à l'état de l'art.
• Développer de nouveaux outils et approches d'analyse pour répondre à de nouvelles questions scientifiques.
• Valoriser les résultats en contribuant activement à leur diffusion, notamment par la participation aux publications scientifiques.
• Collaborer étroitement avec les autres membres de l'équipe et, le cas échéant, avec des partenaires extérieurs.
• Participer à l'animation scientifique de l'équipe (réunions, présentations, échanges méthodologiques).

Activités principales · Analyser des données de transcriptomique et d'épigénomique : Assurer le contrôle qualité, le nettoyage, l'organisation et la normalisation des données, réaliser les comparaisons pertinentes et produire des représentations claires et interprétables des résultats scientifiques. · Développer, déployer et maintenir des méthodes d'analyse de données omiques : Réaliser une revue de la littérature, sélectionner les outils appropriés, les tester, les déployer sur le cluster de calcul, assurer leur maintenance et les appliquer dans le cadre des projets de recherche en cours au sein de l'équipe. · Interagir avec les autres membres de l'équipe : Discuter des choix méthodologiques et des résultats, acquérir les connaissances biologiques nécessaires à la bonne compréhension de chaque projet et participer à la valorisation des travaux, notamment lors de la rédaction des publications scientifiques et de la préparation de supports de présentation.

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Profil

• Versant : Fonction publique d'État
• Type de recrutement : Catégorie A, contractuel·le, CDD 12 mois (article L.332-2,3 du CGFP)
• Formation et/ou qualification : Diplôme d'ingénieur, Master 2, ou équivalent BAC+5, en biologie ou bio-informatique.
• Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : une première expérience dans l'analyse de données de séquençage est la bienvenue mais pas obligatoire.