Ingénieur-e d'étude en bioinformatique

À propos de nous Nantes Université est un établissement public d'enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d'université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l'école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l'École Nationale Supérieure d'Architecture de Nantes. Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l'excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance. Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d'études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon. Mission Le projet du poste proposé s'inscrit dans un programme de recherche international, multicentrique ANR NeoTraid (Neonatal Treg in autoimmune diseases), coordonné par le Dr Cédric Auffray à l'Institut Cochin, Paris, en collaboration avec le Dr Benoit Salomon (Infinity, Toulouse) et le Dr Matthieu Giraud (CR2TI, Nantes). L'objectif général de ce projet est d'étudier l'impact des lymphocytes T régulateurs néonataux (nnTregs) dans le contrôle des maladies auto-immunes chez la souris, en portant une attention particulière au rôle du facteur de transcription Foxo1 dans leur génération et aux moyens de moduler les nnTreg par des micro-organismes. Le/la bioinformaticien-ne recruté-e travaillera spécifiquement sur la dissection des programmes transcriptionnels et épigénétiques contrôlés par Foxo1 dans le développement des lymphocytes T régulateurs thymiques (tTregs). Activités principales

• Activité 1 : Analyse de données transcriptomiques et épigénétiques
• Activité 2 : Analyses bio-informatiques avancées
• Activité 3 : Valorisation et collaboration

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Profil Versant : Fonction publique d'État Type de recrutement : Catégorie A contractuel·le, CDD 2 ans (article L.332-2,3 du CGFP)

• Formation et/ou qualification : Master 2 en Bioinformatique ou Doctorat en Bioinformatique / Biologie computationnelle
• Expériences requises en analyse de données transcriptomiques (RNA-seq, scRNA-seq) et en analyse de données épigénétiques (ATAC-seq, ChIP-seq)
• Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : minimum 2 ans d'expérience sur des projets en immunologie