Alternance - Ingénieur en statistique pour l’halieutique (H/F)

Date de clôture de réception des candidatures : 30 avril 2026 Qui sommes-nous ? Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer, l'Ifremer contribue, par ses travaux et expertises, à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes. L'Ifremer est source de connaissances, d'innovation, de données de surveillance et d'expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d'activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe. Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, et du ministère de la Transition écologique et solidaire. Le laboratoire Écologie et Modèles pour l'Halieutique (EMH) de l'unité Halieutique du Grand Ouest (HALGO) se positionne sur la compréhension du fonctionnement des dynamiques spatio-temporelles des écosystèmes et des pêcheries. Il combine une forte capacité d'observation à la mer avec des compétences d'analyse et de modélisation de ces informations. Il se compose d'une équipe pluri-disciplinaire qui vise à produire des connaissances et outils en appui à l'approche écosystémique de la gestion des pêches. Vous serez positionné(e), à Nantes, dans le laboratoire EMH, membre de l'unité HALGO. Votre encadrement sera assuré par des ingénieurs et chercheurs des laboratoires EMH/LBH. Quelles seront vos missions ? Ifremer est en charge de coordonner ou de contribuer à de nombreuses évaluations de stocks. Ces dernières se basent, en partie, sur des indices d'abondance issus des données de campagnes halieutiques. Certains de ces indices sont encore calculés en utilisant une approche par stratification aussi appelée design-based. Il existe différentes approches pour calculer ces indices, allant de méthodes dites « stratifiées », intégrant des densités moyennes sur un ensemble de strates prédéfinies, jusqu'à des approches de modélisation hiérarchiques prenant explicitement en compte les structures d'autocorrélation spatiale et temporelle. Ces dernières, bien que plus complexes, permettent de caractériser des changements dans le temps et l'espace de distribution des espèces, de compiler différentes sources de données et d'intégrer des co-variables dans le calcul des indices d'abondance. Votre mission consistera à :

1. Compiler et harmoniser différents formats de données.
2. Développer des indices d'abondance en utilisant une approche par modélisation.
3. Effectuer une comparaison des indices calculés par modélisation avec l'approche par stratification.
4. Mettre en place une routine permettant d'automatiser et rendre reproductible le calcul de ces indices.
5. Automatiser la production de rapports présentant la méthode utilisée pour développer ces indices, les cartes de distribution d'espèces ainsi que les indices produits.

Dans un premier temps ce développement d'indices concernera les indices d'abondance d'ores et déjà utilisés pour l'évaluation des stocks d'élasmobranches (raies/requins/pocheteaux) et poissons d'eau profondes pour lesquels Ifremer est impliqué, puis pourra être étendu à d'autres stocks/campagnes halieutiques. Les codes et fonctions développés seront intégrés sous forme de package R pour une meilleure diffusion et documentation. Quelles seront vos activités ?

• Analyse des données issues des campagnes scientifiques halieutiques
• Développement de modèles spatio-temporels d'indice d'abondance
• Mise en place de pipe-lines pour la production d'indices d'abondance
• Rapportage automatique des résultats obtenus
• Documentation et packaging de R

Avec qui allez vous travailler ? En interne : l'encadrement sera assuré par des ingénieurs et chercheurs des laboratoires EMH et LBH de l'UMR DECOD. Des interactions sont attendues au sein des laboratoires et avec l'unité HISSEO, ainsi qu'avec les modélisateurs des autres unités halieutiques de l'Institut. En externe : CIEM. Comment se déroulera votre activité ?

• temps complet
• pas de déplacement
• pas de télétravail

Comment postuler ? Votre dossier de candidature doit comprendre un CV et une lettre de motivation (soit annexée votre CV, soit en personnalisant votre "message au recruteur" Quels sont nos avantages ?

• Nos collaborateurs bénéficient de 12 RTT et congés supra légaux.
• Nous avons une politique d'incitation à la mobilité douce : forfait mobilité durable.
• Nous sommes engagés dans une politique RSE inspirée de nos raisons d'être.

Quelles sont les prochaines étapes ?

• Date limite de dépôt des candidatures : 30/04/2026
• Étude des dossiers
• Entretien de préqualification
• Entretien avec le candidat

Qui êtes-vous ? Vous recherchez un contrat d'apprentissage ou de professionnalisation d'une durée de 1 an. Ingénieur ou Master 2 en modélisation statistique ou écologie quantitative. Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :

• Maîtrise du langage de programmation R
• Maîtrise des outils de recherche reproductible (Git, Quarto)
• Exploration des données et identification des structures présentes dans les données
• Modèles statistiques (GLMM, GAMM)
• Connaissances en halieutique souhaitable
• Maîtrise de l'anglais écrit et parlé

Vous avez les qualités suivantes :

• Rigueur, autonomie, curiosité
• Esprit de synthèse, intégration de connaissances
• Capacités de rédaction, clarté de communication
• Aptitude au travail en équipe